Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGAP10645 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms