Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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VAPBO95292 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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