Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPFIA3O75145 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms