Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCA5O60264 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCA5O60264 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms