Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
O00370 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
O00370 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
O00370 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
O00370 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms