Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms