Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms