Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMNCA6NCL1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms