Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9Y3F1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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