Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED16Q9Y2X0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms