Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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