Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms