Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTSFQ9UBX1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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