Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms