Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGC1AQ9UBK2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARGC1AQ9UBK2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms