Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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