Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GDE1Q9NZC3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GDE1Q9NZC3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDE1Q9NZC3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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