Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms