Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms