Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms