Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CINPQ9BW66 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms