Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms