Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPOCK3Q9BQ16 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms