Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms