Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms