Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDCCAG3Q96C92 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms