Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms