Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms