Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC8BQ8IXV7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC8BQ8IXV7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms