Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms