Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC149Q6ZUS6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms