Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms