Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NANOGP8Q6NSW7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NANOGP8Q6NSW7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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