Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms