Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYSMD4Q5XG99 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYSMD4Q5XG99 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms