Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSD17B12Q53GQ0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms