Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms