Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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