Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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