Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SNAPC1Q16533 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SNAPC1Q16533 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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