Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms