Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEA1Q15075 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEA1Q15075 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms