Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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