Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL4A6Q14031 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms