Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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