Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
COX10Q12887 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
COX10Q12887 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms