Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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