Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA3Q08378 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms