Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms