Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
XPCQ01831 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XPCQ01831 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms